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我所开发了分子生物学新方法

发布时间:2021-04-08 16:01:00.0  |  【打印】 【关闭

      近日,广东省科学院生态环境与土壤研究所(以下简称我所)孙蔚旻研究员团队,自主开发了分子生物学新方法(稳定同位素示踪-宏基因组分箱联用技术),并利用该方法在好氧锑氧化基础研究方面取得了新进展。相关研究成果《Bacteria responsible for antimonite oxidation in antimony-contaminated soil revealed by DNA-SIP coupled to metagenomics》发表在国际环境领域权威期刊《FEMS Microbiology Ecology》(IF=3.675)。
      该方法采用室内微宇宙培养实验,通过对稳定同位素示踪(stable isotope probing,SIP)-宏基因组分箱联用技术进行优化,将SIP直接与宏基因组测序技术相结合,省略了16S rRNA高通量测序步骤;同时,以13C-NaHCO3为唯一碳源,锚定了土壤中驱动好氧锑氧化过程的自养型功能微生物,揭示了这些功能微生物的代谢途径,解析了非淹水期锑污染水稻土壤中的好氧锑氧化过程。
      孙蔚旻自组建团队以来,成功开发并应用分子生物学新方法(稳定同位素示踪-宏基因组分箱联用平台),积极开展相关功能微生物类群鉴定和代谢途径等方面的研究工作,不断通过技术方法的创新,进一步优化完善该技术平台的应用能力。

       

 

Miaomiao Zhang, Max Kolton, Zhe Li, Hanzhi Lin, Fangbai Li, Guimei Lu, Pin Gao, Xiaoxu Sun, Rui Xu, Fuqing Xu, Weimin Sun,2021. Bacteria responsible for antimonite oxidation in antimony-contaminated soil revealed by DNA-SIP coupled to metagenomics.

https://doi.org/10.1021/acs.est.0c01601

 

(土壤生态修复团队 张苗苗/供稿)

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